Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND5BQ6ZUT9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DENND5BQ6ZUT9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DENND5BQ6ZUT9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DENND5BQ6ZUT9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND5BQ6ZUT9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND5BQ6ZUT9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND5BQ6ZUT9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND5BQ6ZUT9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND5BQ6ZUT9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND5BQ6ZUT9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND5BQ6ZUT9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND5BQ6ZUT9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms