Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms