Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms