Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R18Q6NYC8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms