Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms