Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARA3Q6AZY7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms