Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP1BQ659C4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms