Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO2Q5TF58 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO2Q5TF58 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms