Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZFYVE27Q5T4F4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZFYVE27Q5T4F4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms