Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms