Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK2Q5EBM0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms