Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL22Q53GT1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms