Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms