Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms