Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MICAQ29983 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MICAQ29983 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MICAQ29983 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MICAQ29983 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MICAQ29983 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MICAQ29983 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MICAQ29983 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MICAQ29983 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MICAQ29983 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MICAQ29983 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MICAQ29983 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MICAQ29983 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MICAQ29983 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MICAQ29983 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms