Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDO1Q16878 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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