Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTPRNQ16849 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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