Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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