Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMA4Q16363 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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