Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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VAMP3Q15836 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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VAMP3Q15836 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VAMP3Q15836 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VAMP3Q15836 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VAMP3Q15836 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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VAMP3Q15836 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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VAMP3Q15836 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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VAMP3Q15836 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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