Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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