Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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