Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms