Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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