Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
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SHROOM2Q13796 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
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SHROOM2Q13796 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SHROOM2Q13796 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHROOM2Q13796 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
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