Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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