Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
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