Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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