Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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PTPRSQ13332 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRSQ13332 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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PTPRSQ13332 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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PTPRSQ13332 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
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PTPRSQ13332 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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PTPRSQ13332 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRSQ13332 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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