Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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