Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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CALCOCO2Q13137 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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