Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms