Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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