Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD47Q08722 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD47Q08722 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD47Q08722 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD47Q08722 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD47Q08722 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD47Q08722 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD47Q08722 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CD47Q08722 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms