Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PSME1Q06323 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms