Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIST1H1AQ02539 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms