Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIM1P81133 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SIM1P81133 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIM1P81133 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIM1P81133 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIM1P81133 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIM1P81133 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIM1P81133 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIM1P81133 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIM1P81133 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIM1P81133 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIM1P81133 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIM1P81133 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIM1P81133 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIM1P81133 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIM1P81133 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIM1P81133 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIM1P81133 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIM1P81133 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIM1P81133 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIM1P81133 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIM1P81133 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIM1P81133 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIM1P81133 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIM1P81133 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIM1P81133 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIM1P81133 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIM1P81133 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIM1P81133 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIM1P81133 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms