Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms