Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms