Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11AP62491 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11AP62491 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms