Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms