Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAG2P55895 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAG2P55895 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAG2P55895 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAG2P55895 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RAG2P55895 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAG2P55895 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAG2P55895 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAG2P55895 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAG2P55895 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAG2P55895 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAG2P55895 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAG2P55895 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAG2P55895 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAG2P55895 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAG2P55895 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAG2P55895 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAG2P55895 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAG2P55895 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAG2P55895 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAG2P55895 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAG2P55895 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAG2P55895 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAG2P55895 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAG2P55895 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAG2P55895 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms