Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIF1P55008 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIF1P55008 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIF1P55008 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AIF1P55008 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AIF1P55008 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AIF1P55008 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AIF1P55008 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AIF1P55008 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AIF1P55008 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AIF1P55008 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AIF1P55008 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AIF1P55008 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AIF1P55008 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AIF1P55008 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
AIF1P55008 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AIF1P55008 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AIF1P55008 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AIF1P55008 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AIF1P55008 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AIF1P55008 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AIF1P55008 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AIF1P55008 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AIF1P55008 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AIF1P55008 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AIF1P55008 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AIF1P55008 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AIF1P55008 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AIF1P55008 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AIF1P55008 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AIF1P55008 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AIF1P55008 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AIF1P55008 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AIF1P55008 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AIF1P55008 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AIF1P55008 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AIF1P55008 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AIF1P55008 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AIF1P55008 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms