Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUCLG1P53597 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUCLG1P53597 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms