Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms