Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP153P49790 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP153P49790 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP153P49790 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP153P49790 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP153P49790 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP153P49790 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP153P49790 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP153P49790 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP153P49790 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP153P49790 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP153P49790 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP153P49790 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP153P49790 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP153P49790 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP153P49790 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP153P49790 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP153P49790 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP153P49790 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP153P49790 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP153P49790 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP153P49790 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP153P49790 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.39■■■□□ 2.77
NUP153P49790 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUP153P49790 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUP153P49790 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUP153P49790 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NUP153P49790 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUP153P49790 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUP153P49790 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUP153P49790 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUP153P49790 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUP153P49790 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUP153P49790 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUP153P49790 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUP153P49790 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP153P49790 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP153P49790 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP153P49790 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP153P49790 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP153P49790 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP153P49790 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP153P49790 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP153P49790 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP153P49790 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP153P49790 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP153P49790 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP153P49790 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP153P49790 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP153P49790 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP153P49790 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP153P49790 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP153P49790 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP153P49790 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP153P49790 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms