Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK1P49759 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK1P49759 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK1P49759 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK1P49759 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK1P49759 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK1P49759 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK1P49759 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK1P49759 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK1P49759 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK1P49759 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK1P49759 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK1P49759 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK1P49759 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK1P49759 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLK1P49759 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLK1P49759 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLK1P49759 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLK1P49759 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK1P49759 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK1P49759 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms