Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC11A1P49279 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms