Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLCP48506 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLCP48506 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLCP48506 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLCP48506 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLCP48506 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLCP48506 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLCP48506 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLCP48506 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLCP48506 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLCP48506 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLCP48506 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLCP48506 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLCP48506 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLCP48506 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLCP48506 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLCP48506 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLCP48506 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLCP48506 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLCP48506 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLCP48506 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLCP48506 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLCP48506 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLCP48506 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLCP48506 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLCP48506 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLCP48506 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLCP48506 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLCP48506 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLCP48506 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLCP48506 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLCP48506 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLCP48506 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLCP48506 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms