Protein–RNA interactions for Protein: P47872

SCTR, Secretin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCTRP47872 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCTRP47872 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCTRP47872 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCTRP47872 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCTRP47872 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCTRP47872 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCTRP47872 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCTRP47872 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCTRP47872 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCTRP47872 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCTRP47872 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCTRP47872 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCTRP47872 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCTRP47872 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCTRP47872 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCTRP47872 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCTRP47872 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCTRP47872 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCTRP47872 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCTRP47872 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCTRP47872 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SCTRP47872 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCTRP47872 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCTRP47872 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCTRP47872 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCTRP47872 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCTRP47872 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCTRP47872 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCTRP47872 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCTRP47872 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCTRP47872 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCTRP47872 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCTRP47872 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms